답부터 먼저 드리면 출퇴근에 쓰인 비용은 공제가 안됩니다.
http://www.irs.gov/pub/irs-pdf/p463.pdf
위 파일의 page 14를 보시면 Main job 과 거주지와의 Commuting Expense는 Never Deductible이라고 나옵니다. 또 Page 15에는 "You cannot deduct commuting expenses no matter how far your home is from your regular place of work."
따라서 안타깝게도 Commuting Expense는 비용처리가 안 됩니다.
감사합니다.